Químicos de la Universidad del País Vasco han descrito, utilizando la secuenciación masiva de RNA, las consecuencias que la falta de proteínas específicas produce en el desarrollo de hongos filamentosos del genero Aspergillus. El trabajo es portada del último número de la revista Genetics, ilustrada por expertos en diseño y tatuajes.
El número de abril de la revista Genetics, editada por la Genetics Society of America (GSA), dedica su portada a un artículo publicado por investigadores de la Facultad de Ciencias Químicas de la Universidad del País Vasco (UPV/EHU) en San Sebastián.
La imagen de la portada está realizada por la diseñadora Elixabet Oiartzabal-Arano y el tatuador Pablo Hernández. Esta sinergia entre arte urbano y ciencia muestra la estructura celular que da lugar a las esporas asexuales, o conidias, del hongo modelo Aspergillus nidulans, mientras que en el fondo se representan los resultados obtenidos en la secuenciación de RNA realizada.
Los hongos tienen un gran impacto económico. En la industria son utilizados como fuente de encimas o antibióticos. Pero, al mismo tiempo, producen importantes daños económicos al causar infecciones en plantas (arroz, trigo, maíz…), frutas y humanos. La capacidad infectiva aumenta debido a la rápida dispersión en el aire u otros medios de sus conidias.
El artículo está relacionado con la línea de investigación básica del grupo, que analiza los procesos genéticos y moleculares que inducen la generación de conidias.
“Hemos seleccionado una cepa del hongo que es capaz de formar conidias –explica el profesor Oier Etxebeste, uno de los autores–, y con ello, propagarse en distintos medios, y una cepa mutante que es incapaz de realizar esta tarea. Tras ello, les hemos extraído a ambas el RNA, que es el intermediario entre la molécula que guarda la información necesaria para que funcionen las células, el DNA, y la molécula que ejecuta esa información, las proteínas.
Una fotografía de los procesos celulares
La secuenciación y comparación de ambas muestras permite obtener una fotografía general de cuáles son los procesos celulares que están afectados en el mutante incapaz de formar conidias. A partir de ahí hemos identificado nuevos genes que participan en el control del desarrollo y otros que intervienen en la síntesis de moléculas que permiten al hongo defenderse ante otros microorganismos. El objetivo es conocer los diferentes mecanismos que utiliza este tipo de hongos para su propagación y abrir así la puerta a nuevas estrategias de control de las infecciones que causan”.
El estudio ha estado liderado por los profesores Oier Etxebeste y Unai Ugalde, junto con Eduardo Espeso del Centro de Investigaciones Biológicas (CSIC) y Ana Gorostidi del Instituto BioDonostia. El trabajo experimental lo han llevado a cabo Aitor García, investigador postdoctoral de la Universidad Rockefeller de Nueva York, y Elixabet Oiartzabal-Arano, doctoranda de la UPV/EHU.
Referencia bibliográfica:
Elixabet Oiartzabal-Arano, Aitor Garzia, Ana Gorostidi, Unai Ugalde, Eduardo A. Espeso, and Oier Etxebeste. "Beyond Asexual Development: Modifications in the Gene Expression Profile Caused by the Absence of the Aspergillus nidulans Transcription Factor FlbB’. Genetics 199:1127-1142 , abril de 2015.
La Real Academia Sueca de las Ciencias ha concedido la mitad de este galardón al bioquímico estadounidense David Baker por diseñar desde cero nuevas proteínas mediante su programa RoseTTAFold. La otra mitad la comparten el británico Demis Hassabis y el también estadounidense John M. Jumper, ambos de la empresa DeepMind de Google, que lograron predecir las estructura proteicas con IA.
Un estudio internacional con participación del CSIC ha demostrado que reemplazar un solo átomo en posiciones estratégicas de la secuencia genética puede revertir su dirección de rotación. Según los autores, el hallazgo podría convertirse en una importante diana terapéutica al desempeñar un papel importante en diversos procesos biológicos.
